02 - Mestrado - Genética e Biologia Molecular
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Navegando 02 - Mestrado - Genética e Biologia Molecular por Autor "Almeida, Fernanda Simões de [Orientador]"
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Item Análise genética do plantel de peixes para repovoamento da estação de piscicultura de Salto Grande-SPMenezes, Débora Carolina Lampe; Almeida, Fernanda Simões de [Orientador]; Zanatta, Augusto Seawright; Vilas-Bôas, Laurival AntônioResumo: Os peixes de água doce são de extrema importância para a economia, sendo utilizados não só para consumo, mas também para pesca esportiva e para turismo Assim, os interesses por esses recursos vivos são vários, existindo a necessidade de estudos destas espécies, para que ocorra a correta manutenção desses organismos A piscicultura visa o abastecimento para consumo de peixes, para o repovoamento de habitats alterados e preservação de espécies ameaçadas Com os marcadores microssatélites podem ser avaliados: sistemas de cruzamento, fluxo gênico e estrutura genética dos estoques de peixes tanto de cativeiros bem como das populações naturais Neste estudo, foi analisada a variabilidade genética de três espécies: Prochilodus lineatus, Piaractus mesopotamicus e Salminus brasiliensis, cultivadas na Estação de Hidrobiologia e Aquicultura de Salto Grande- SP para estocagem no Rio Paranapanema Foram analisadas para cada espécie três populações distintas: de matriz, de alevinos e um correspondente a população natural As três populações mostraram alelos privados na População Natural, P lineatus e P mesopotamicus apresentaram também na Matriz Dentre as nove populações analisadas, oito delas apresentaram FIS positivo indicando que a maioria esta sofrendo endogamia Quando observado os dados de variância molecular (AMOVA), as três espécies mostraram que a maior variação se encontra entre os indivíduos Apenas P lineatus apresentou indícios de gargalo genético As análises de FST corroboram com os dados encontrados pelo Structure, mostrando que algumas espécies apresentam uma diferenciação genética entre as populações desde baixa (,2) a alta (,175), sendo maiores nas comparações entre as populações de cativeiro e a população natural As analises de irmandade mostram um alto nível de parentesco entre eles, onde o número de famílias encontradas variou de um a quatro dentro das populações, com vários indivíduos pertencendo a uma mesma família Deste modo, percebe-se que o manejo para cultivo destas espécies está inadequado, com baixo número de parentais para a produção de alevinos, o que tem levado a perda da variabilidade genética e uma maior diferenciação com a população natural (população receptora) Indica-se a necessidade de um manejo genético correto para que ocorra a conservação dessas espécies em seu habitat naturalItem Análise genética e determinação dos haplótipos de Chelonia mydas (Linnaeus, 1758) (Testudines: Cheloniidae) resgatados no litoral do ParanáSavada, Camila Satie; Almeida, Fernanda Simões de [Orientador]; Miranda, Thaís Pires; Bracarense, Ana Paula Frederico Rodrigues Loureiro; Domit, Camila [Coorientadora]Resumo: Atualmente, são descritas sete espécies de tartarugas marinhas com distribuição circumglobal, que migram grandes distâncias entre as regiões de alimentação e nidificação Chelonia mydas, também conhecida como tartaruga verde, é uma das cinco espécies que ocorrem no litoral do Brasil São animais herbívoros que possuem regiões de desova e alimentação no litoral, sendo altamente influenciados pela ação antrópica, como a perda de habitat, poluição e captura acidental em redes de pesca A região do litoral do estado do Paraná é identificada como uma das regiões de alimentação para essa espécie no Atlântico Sul Esse trabalho tem como objetivo identificar a diversidade genética de C mydas, definindo os haplótipos que ocorrem na região e comparando com outras regiões de alimentação descritas para o oceano Atlântico As amostras foram coletadas entre os anos de 27 a 214 Foram analisadas 285 amostras, com média de CCC (Comprimento Curvilíneo da Carapaça) de 3,65 cm Através da amplificação de um fragmento da região controle do DNAmt foram identificados doze haplótipos, sendo o haplótipo CM-A8 o mais frequente (195 indivíduos) Dez haplótipos ocorreram com frequência menor que 5%, incluindo os haplótipos CM-A23 e CM-A32 observados uma única vez Resultados da AMOVA (Análise de Variância Molecular) mostram maior diferença entre os dois grupos principais das populações (Atlântico Norte e Atlântico Sul) quando comparados com as distâncias entre as populações dentro dos grupos Além disso, considerando os valores de FST e FST o Paraná possui valores significativos para a maioria das comparações, incluindo todas as áreas da região do Atlântico Norte A frequência dos haplótipo e os valores de divergência genética destacam as peculiaridades do grupo de indivíduos que formam o estoque misto presente no litoral do Paraná e que sofrem a influência das correntes oceânicas e mudanças climáticas Com isso, informações obtidas referentes a utilização da área de alimentação do litoral do Paraná pelas tartarugas verdes, confirmam a importância da preservação desse local para manter a diversidade genética das populações e possibilitar a utilização dessas informações para a elaboração de futuros planos de manejoItem Identificação molecular de embriões e larvas de peixes (Teleostei: Osteichthyes) da bacia do médio-baixo rio ParanapanemaSilva, Wilson Frantine da; Almeida, Fernanda Simões de [Orientador]; Morelli, Karina Alessandra; Oliveira, Cláudio de; Sofia, Sílvia Helena [Coorientadora]Resumo: Ações antrópicas têm incidido fortes impactos sobre a ictiofauna, influindo no sucesso reprodutivo destas espécies, e em muitos casos, comprometendo sustentabilidade das populações de peixes Deste modo, avaliar quais espécies completa efetivamente o recrutamento populacional é imprescindível para traçar medidas de conservação eficazes Uma das abordagens mais eficientes para avaliação do processo de recrutamento é quantificação e identificação de ovos e larvas, embora, a identificação de indivíduos em diferentes fases de desenvolvimento seja extremamente complexa Neste contexto, objetiva-se com o presente estudo identificar os produtos reprodutivos de peixes (ovos e larvas) através do uso da metodologia DNA barcoding, relacionando os produtos reprodutivos com suas respectivas espécies no Rio Paranapanema, bacia do alto Rio Paraná Amostragens foram realizadas ao longo do período de maior atividade reprodutiva dos peixes (outubro a fevereiro) entre os anos de 212 e 213, em diferentes pontos da bacia do médio rio Paranapanema Análises de distância genética a partir de sequências do gene CO1 de aproximadamente 648pb possibilitaram a identificação de 99,81% das 536 amostras de ovos (293) e larvas (243) submetidas à análise, resultando em 37 espécies distribuídas em 27 gêneros, 15 famílias e quatro ordens Os tributários da porção lótica do reservatório de Capivara mostraram a maior riqueza de espécies e densidade de ovos, bem como a maior frequência de espécies migradoras A identificação molecular de ovos contribuiu com cerca de 3% da riqueza de espécies, além de indicar a existência de táxons restritos a este tipo de material Os resultados apresentados demonstram a eficiência da abordagem DNA barcoding na identificação molecular do ictioplâncton, fornecendo informações precisas para programas manejo e conservaçãoItem Identificação molecular e variação temporal de ovos e larvas de peixes (Teleostei: Osteichthyes) em zonas de influência de reservatórios no rio ParanapanemaLima, Same Costa; Almeida, Fernanda Simões de [Orientador]; Birindelli, José Luís Olivan; Pereira, Luiz Henrique GarciaResumo: A intensa construção de barragens e formação de reservatórios constitui o principal fator de impacto nas bacias hidrográficas brasileiras levando a uma série de distúrbios físico-químicos o que acaba por influenciar sobre a reprodução das espécies de peixes ali presentes e interferir diretamente na composição da ictiofauna Informações sobre uma comunidade se tornam mais completas quando incluídas informações sobre a história de vida das espécies, inclusive nos estágios iniciais Assim, a análise da composição e abundância de ovos e larvas de peixes é fundamental no sentido de trazer informações sobre o sucesso de permanência das espécies através da reprodução em razão dos distúrbios causados por barramentos Este trabalho objetivou por meio da técnica DNA barcoding realizar a identificação de ovos e larvas de peixes coletados em zonas de influência de barragens inseridas ao longo do rio Paranapanema, para avaliar a composição e abundância do ictioplâncton em diferentes períodos e com diferentes características ambientais Para tanto, foram realizadas coletas entre setembro 213 a março de 214 e setembro de 214 a março de 215 Das 961 sequências do gene (COI) obtidas a partir das amostras, 85 (88,5%) puderam ser identificadas precisamente a nível específico, totalizando 43 espécies Considerando o total de amostras analisadas (961), resultaram em 6 ordens, 2 famílias, 38 gêneros e 52 unidades taxonômicas distintas As ordens mais abundantes foram Siluriformes (52,1%) e Characiformes (4,8%) seguidas dos Perciformes (6%), Cyprinodontiformes (,5%), Gymnotiformes (,3%) e Pleuronectiformes (,1%) Uma maior riqueza de espécies pode ser observada em trechos lóticos de tributários, em especial para o rio das Cinzas e Tibagi, contrastando com a presença marcante de espécies invasoras como Serrasalmus marginatus e Plagioscion squamosissimus em trechos lênticos A identificação a nível específico pode revelar entre amostras analisadas cerca de 3% das espécies registradas para a bacia do rio Paranapanema, bem como casos de espécies crípticas, trazendo informações valiosas acerca do recrutamento de peixes ao longo de uma bacia fragmentada por sucessivas barragens, contribuindo para a criação de planos de manejo efetivosItem Uso do DNA barcode na identificação de ovos de peixes nos tributários da UHE Capivara, bacia do rio ParanapanemaLima, Moema Cristina Costa de; Almeida, Fernanda Simões de [Orientador]; Swarça, Ana Cláudia; Dias, Ana LúciaResumo: A construção de barramentos e a estocagem de água são os principais fatores que promovem a perda da biodiversidade de peixes em ecossistemas aquáticos continentais Os barramentos influenciam a reprodução das espécies de peixes ali presentes, consequentemente interferindo na composição da ictiofauna Portanto, identificar quais espécies completam seu processo de recrutamento em ambientes alterados é imprescindível para traçar medidas de conservação eficazes A análise da composição e abundância de ovos e larvas de peixes traz informações sobre o sucesso de permanência das espécies por meio da reprodução em razão dos distúrbios causados por barramentos Contudo, a classificação de diferentes fases de desenvolvimento é complexa, uma vez que muitas das características que distinguem as espécies ainda não estão desenvolvidas nas fases iniciais dos organismos Desta forma, a ferramenta DNA barcode vem sendo utilizada para identificar e classificar espécies mesmo nas fases iniciais do desenvolvimento O rio Paranapanema possui ao longo de sua calha principal 11 Usinas hidrelétricas, a maior é a UHE Capivara, que possuí como maiores tributários os rios Tibagi e Cinzas Estudos de identificação de ictioplâncton no rio Paranapanema apontam uma grande diversidade para esses tributários Neste contexto, o presente estudo teve como objetivo identificar, por meio da utilização da técnica de DNA barcode, ovos capturados nos tributários, rio das Cinzas e Tibagi Das 928 sequências analisadas, 99,78% foram indentificadas a nível específico quando confrontadas com o banco de dados Boldsystems® Resultando em 25 espécies, 11 famílias e 2 ordens Das 25 espécies encontradas, mais da metade (6%) possuem hábito de deslocamento reprodutivo, indicando que os afluentes desse reservatório estão sendo utilizados como rota migratória por estas espécies Além disso, foram encontrados ovos de espécies raras para o médio Paranapanema tais como, Pseudoplatystoma corruscans e Piaractus mesopotamicus e ovos da espécie ameaçada de extinção Pseudopimelodus mangurus, indicando estes tributários como área de desova para estas espécies Os resultados deste estudo demonstraram, a importância da identificação de ovos de peixes em ambientes influenciados por reservatórios para reconhecer as áreas de reprodução de espécies nativas e ameaçadas, bem como a importância dos rios Tibagi e Cinzas para a manutenção de espécies nativas do rio Paranapanema