Uso de painéis de marcadores SNP para teste de paternidade e avaliação genômica de embriões biopsiados de bovinos nelore
Data
2023-02-27
Autores
Marestone, Bruna Silva
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Resumo
Touros jovens podem ser selecionados através das avalições genômicas e utilizados como reprodutores, proporcionando melhorias na elaboração de estratégias para o melhoramento genético de bovinos. A seleção genômica tem o objetivo de utilizar SNPs (Single Nucleotide Polymorphism – Polimorfismos de Nucleotídeo Único) como ferramentas auxiliares na predição de valores genéticos mais acurados, contribuindo para um processo de seleção mais eficaz e auxiliando na identificação correta do parentesco e todo o pedigree. Assim, o objetivo do trabalho foi primeiramente avaliar diferentes densidades de painéis de marcadores SNPs na identificação da paternidade de bovinos da raça Nelore. Posteriormente, realizou-se outro estudo com o objetivo de avaliar a viabilidade da predição dos valores genéticos de embriões biopsiados, com painéis de moderada densidade e imputados para painéis com maiores densidades. No primeiro estudo foram genotipados, em painéis HD, 2027 animais, sendo 1883 produtos e 144 touros. Cinco painéis foram testados, sendo eles o painel desenvolvido pela International Society of Animal Genetics (ISAG) possuindo 166 SNPs (Painel ISAG), um painel contemplando 10K SNPs e três painéis customizados, contendo 98 (Painel 100), 206 (Painel 200) e 311 (Painel 300) SNPs selecionados, acrescidos de 166 SNPs provenientes do painel ISAG, para a avaliação da paternidade no software FImpute. No segundo estudo utilizou-se 93 embriões provenientes da coleta dos óvulos de 28 doadoras, que foram fertilizados in vitro utilizando sêmen de dois touros. Todos os embriões foram genotipados utilizando o chip 50K e posteriormente os genótipos foram imputados para o painel HD. Os embriões foram implantados nas vacas receptoras e, após o nascimento, a genotipagem de 10 bezerros foi realizada, assim como a estimativa dos seus valores genéticos genômicos. Entre os painéis customizados, o Painel 200 foi eficiente para validação do parentesco de todas as progênies. A qualidade da genotipagem dos embriões foi satisfatória, sendo o call rate médio das amostras de 93%, a média de heterozigosidade dos genótipos imputados (22,5%) foi maior do que nos genótipos observados (11,7%), e a correlação observada entre os índices de seleção de embrião e bezerro foi de 99,3%. Conclui-se que o painel ISAG não foi suficiente para avaliar a paternidade dos animais da raça Nelore, criados nacionalmente, sendo necessário acrescentar 206 SNPs ao painel para se obter a identificação entre touro e progênie. Os valores genéticos genômicos estimados a partir dos genótipos dos embriões biopsiados apresentaram alta correlação com os valores estimados posteriormente para os bezerros, demonstrando grande potencial de aplicação na produção animal, para seleção de animais ainda na fase embrionária.
Descrição
Palavras-chave
Gado de corte, ISAG, Marcadores moleculares, Parentesco, Valor genético, Bovinos de corte, Animais - Melhoramento genético, Nelore (Zebu)