Validação de uma coleção de Coffea arabica com marcadores moleculares SNPs

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Oliveira, Henrique Marques de

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Resumo

Resumo: Como constituem as formas mais abundantes de variações do genoma, os polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) podem auxiliar na caracterização de recursos genéticos, inclusive de espécies que possuem variabilidade genética reduzida como Coffea arabica Com aumento da eficiência e acessibilidade das tecnologias de sequenciamento, uma grande quantidade de dados está sendo produzida Partindo deste princípio o presente trabalho visa otimizar a técnica de validação de SNPs através do método Snapshot Foram selecionados os SNPs, 4, 5, 6, 15 e 17, observados por YANAGUI, 21 que foram testados em 11 genótipos Dos 5 (cinco) SNPs testados apenas o SNP17 não apresentou diferenças alélicas intraespecíficas, enquanto o SNP6 apresentou 3 (três) perfis polimórficos e o restante apresentou 2(dois) perfis polimórficos O SNP5 foi selecionado para ser testado em 143 genótipos de uma coleção da Etiópia, apresentando 3 (três) perfis polimórficos diferentes, evidenciando a existência de variabilidade intraespecífica

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Palavras-chave

Café, Biotecnologia, Polimorfismo (Genética), Coffea arabica, Melhoramento genético, Coffee, Genetic polymorphism, Coffea arabica - Breeding, Molecular markers, Biological markers, Biotechnology

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