Predição, análise e validação de RNAs não codificadores (ncRNAs) em Bacillus thuringiensis
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Appel, Renan José Casarotto
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Resumo
Resumo: A visão clássica do dogma central da biologia molecular passou por mudanças de paradigma na virada deste século, quando avanços, principalmente em análises de bioinformática, contribuíram para a descoberta de que muito do que era transcrito nos organismos eram regiões não traduzidas em proteínas, e que apresentariam função biológica Tais transcritos foram denominados como RNAs não codificadores (ncRNAs) Motivados por tais descobertas, novos métodos computacionais dedicados à ncRNAs foram propostos, possibilitando estudos de ocorrência e distribuição em genomas de diversos microrganismos Bacillus thuringiensis (Bt), uma bactéria com características entomopatogênicas, é utilizada em todo o mundo no controle de pragas e vetores de doenças e ainda não foi analisada com respeito a estas moléculas A maioria dos processos ligados à virulência, capacidade necrotrófica e esporulação desta bactéria dependem de sistemas quorum sensing, porém, estas vias não estão totalmente elucidadas e ncRNAs podem estar atuando junto às mesmas Desta forma, este trabalho objetivou identificar, analisar e validar ncRNAs em três linhagens dessa espécie As sequências completas de cromossomos e plasmídeos dos genomas das linhagens Bt47, HD-1 e HD73 foram selecionados Ao todo, foram identificados 27111 possíveis ncRNAs; sendo 1874 candidatos considerados significativos, distribuídos em 177 famílias distintas encontradas principalmente em regiões presentes nas três linhagens As moléculas identificadas estão envolvidas em processos regulatórios complexos principalmente relacionados à virulência, patogenicidade, resistência e sobrevivência da bactéria A família epsC teve sua expressão validada no genoma Os resultados alcançados evidenciam que mesmo bactérias muito relacionadas filogeneticamente podem apresentar diferentes respostas às modificações ambientais, apresentando diferentes padrões de expressão; e ainda levam a uma nova linha de investigação para a compreensão de mecanismos fisiológicos em B thuringiensis
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Palavras-chave
Bioinformática, Genômica, Controle biológico, Bacillus thuringiensis, Genética molecular, Bioinformatics, Genomics, Bacillus thurigiensis, Molecular genetics