Caracterização epidemiológica e molecular de Klebsiella Pneumoniae e providencia Stuartii de isolados de pacientes de um hospital de referência de COVID-19 do sul do Brasil
Data
2023-04-20
Autores
Magalhães, Gerusa Luciana Gomes
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Resumo
A emergência e disseminação de resistência às polimixinas em Klebsiella pneumoniae está aumentando em todo o mundo, tornando–se um sério problema de saúde pública. Também, durante a pandemia de COVID-19, Providencia stuartii resistentes aos carbapenêmicos (PsCR) tornou-se um sério problema na terapia antimicrobiana. Neste contexto, este trabalho teve como objetivos caracterizar K.pneumoniae isoladas da corrente sanguinea (ICS) resistentes aos carbapenêmicos e às polimixinas (KpnCRPR) de 2015 à 2020 e investigar o aumento de cepas de PsCR de abril a setembro de 2021 de pacientes do Hospital Universitário de Londrina (HU-UEL). Foram estudados 44 isolados de KpnCRPR e 21 isolados de PsCR. As amostras foram identificadas pelo sistema de automação Vitek2®. O sequenciamento completo do genoma foi realizado de acordo com os protocolos e a plataforma Illumina. As bases de dados Enterobase, MLST, NCBI e GenBank foram utilizadas para a análise do sequenciamento. O sequenciamento de KpnCRPR mostrou que todos os isolados apresentaram blaKPC-2, blaTEM 1D e blaSHV-11 e resistência às polimixinas devido o gene mrgB. O sequence Type (ST) 11 foi identificado em 40 (91%) e ST 258 em 4 (9%) isolados. KpnCRPR apresentaram 5 grupamentos principais, com pequenas variabilidades genéticas nos grupos D e E. O índice de comorbidade de Charlson mostrou que 68,1% dos pacientes com ICS tinham pontuação > 2. Todos os pacientes foram submetidos a algum tipo de procedimento invasivo, como: cateter venoso central (CVC) 77,3%, ventilação mecânica (VM) 72,7%, sonda vesical de demora (SVD) 34,1% e hemodiálise (HD) 22,7%. O uso prévio de polimixinas foi observado em 72,7% dos pacientes e 59% evoluíram para óbito. Os isolados de PsCR apresentaram a enzima NDM-1 e relação clonal acima de 87% de similaridade genética entre os isolados, determinada pelo ERIC-PCR. Quando comparados os dados clínicos dos pacientes com infecção por P. stuartii NDM-1 com P. stuartii não NDM-1, os resultados significativos foram: COVID-19 positivo (p = 0,013); uso de procedimentos invasivos como: CVC (p = 0,012), VM (p= 0,006), HD (p= 0,033) e SVD (p= <001). O uso prévio de aminoglicosídeos (p= 0,025), polimixinas (p= 0,038), tigeciclina (p= 0,033), vancomicina (p= 0,045); e o desfecho clínico óbito (p= 0,021). Diante dos resultados obtidos, concluímos que estudos moleculares de isolados de interesse clínico fornecem uma compreensão da diversidade genética da população bacteriana, contribuindo com informações importantes para controle da disseminação destes mecanismos de resistência no ambiente hospitalar
Descrição
Palavras-chave
Providencia stuartii, Klebsiella pneumoniae, Carbapenemases, NDM, KPC, Fisiopatologia clínica, Terapia antimicrobiana, Bactérias