Análise genômica de Streptomyces albidoflavus LABIM42: da extração do DNA à identificação de clusters biossintéticos
Data
0025-12-09
Autores
Baptista Junior, Roberto Rodrigues
Título da Revista
ISSN da Revista
Título de Volume
Editor
Resumo
O presente trabalho aborda o processo que se estende desde a avaliação da atividade antifúngica até a extração de DNA genômico e a mineração de metabólitos secundários em microrganismos de interesse biotecnológico. A metodologia empregada utilizou o sistema automatizado Extracta 16 (Loccus), baseado em partículas magnéticas, para a purificação de DNA de alta qualidade. Após a extração, as amostras foram avaliadas quanto à integridade (eletroforese em gel de agarose), concentração (fluorimetria – Qubit) e pureza (Nanodrop, razão A260/A280). O sequenciamento foi realizado utilizando duas plataformas: Illumina (leituras curtas 2×150 pb) e Oxford Nanopore Technologies (leituras longas via MinION), permitindo uma abordagem híbrida de montagem. A partir do genoma montado, ferramentas de bioinformática foram empregadas para identificar clusters biossintéticos e potenciais vias de síntese de compostos bioativos. Os resultados reforçam a importância da integração entre metodologias moleculares e análises computacionais para a prospecção de metabólitos com potencial agronômico.
Descrição
Palavras-chave
Sequenciamento híbrido, Illumina, Nanopore, Mineração genômica, Metabólitos secundários, Streptomyces