Primeiro relato de Edwardsiella piscicida em Pintado (Pseudoplatystoma corruscans) no Brasil: caracterização genômica
Data
2023-02-27
Autores
Ferrari, Natália Amoroso
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Resumo
Uma cepa diferente de Edwardsiella piscicida foi descrita pela primeira vez na América Latina, Sul do Brasil. Sabe-se que esta espécie é responsável por muitos surtos, acometendo principalmente bagres, em países como os Estados Unidos, mas ainda não se sabe quão difundida está na piscicultura do Brasil, e qual seu potencial impacto para os peixes nativos e de cultivo. Desta forma, objetivo do primeiro artigo foi sequenciar o genoma completo da cepa BEP80 isolada de pintados (Pseudoplatystoma corruscans), como passo inicial para a comparação com as demais cepas desta espécie circulantes no mundo. Para isso, o DNA foi extraído e o genoma foi sequenciado através da plataforma Illumina HiSeq 2500. As anotações foram feitas através do Prokaryotic Genome Annotation Pipeline (PGAP) e a busca por genes adquiridos de resistência a antimicrobianos e plasmídeos utilizando os softwares ResFinder e PlasmidFinder foi realizada. Não foram encontrados plasmídeos ou genes de resistência, no entanto, a cepa demonstrou ser multirresistente no teste fenotípico com resistência às classes: aminoglicosídeos, polipeptídios, lincosamidas, sulfonamidas e tetraciclinas. Os objetivos do segundo artigo foram verificar a susceptibilidade de pintados (Pseudoplatystoma corruscans) e tilápias do Nilo (Oreochromis niloticus) à cepa BEP80, analisar os genes de virulência envolvidos na sua patogenicidade e realizar uma comparação entre as cepas isoladas em diferentes países através de análise filogenômica. Para isso, seis juvenis das espécies a cima citadas foram desafiados experimentalmente pela via intraperitoneal (IP), na dose de 0,1mL de inóculo na densidade de 1011 UFC/mL. Houve mortalidade de 100% dos pintados e tilápias do Nilo após 24 e 48h do desafio, respectivamente. Também foi realizada análise de ilhas genômicas, com foco nas ilhas de patogenicidade, a fim de pesquisar genes envolvidos com fatores de virulência. Foram identificadas 37 ilhas genômicas, sendo 15 patogênicas, nove de resistência, nove de simbiose e quatro metabólicas. Sistemas de secreção do tipo III e VI, reguladores gênicos, proteases, proteínas relacionadas a adesão e colonização do hospedeiro e a resistência ao estresse ambiental foram encontradas. A análise filogenética demonstrou 96% de similaridade com cepas isoladas de bagre-americano (Ictalurus puncatus) no Mississipi. Dessa forma, é possível concluir que a cepa de Edwardsiella piscicida isolada no Brasil quando comparada as demais cepas disponíveis nos bancos de dados apresenta diferenças na constituição de seu genoma. Além disso, é patogênica e altamente virulenta, tanto para pintados quanto para tilápias do Nilo, demonstrando um potencial para transmissão interespécies e apresenta multirresistência a cinco classes de antimicrobianos.
Descrição
Palavras-chave
Antimicrobianos, Edwardsielose, Filogenômica, Ilhas de patogenicidade, Transmissão interespécies