Taxonomia polifásica de isolados de Chamaecrista fasciculata e descrição da nova espécie Bradyrhizobium niftali
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Klepa, Milena Serenato
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Resumo
Resumo: O crescimento e desenvolvimento vegetal estão intimamente relacionados com a disponibilidade de certos nutrientes no solo O nitrogênio é necessário devido à sua participação vital em processos biológicos estruturais, metabólicos e genéticos A principal via de incorporação de nitrogênio à biosfera se dá através da fixação biológica de nitrogênio (FBN), um processo dependente da redução enzimática do N2 atmosférico em formas assimiláveis para espécies vegetais A habilidade de fixar N2 é restrita a um grupo restrito de bactérias, dentre as quais, os rizóbios se destacam por estabelecerem relações simbióticas com plantas da família Fabaceae, através de estruturas especializadas, denominadas nódulos Recentemente, um estudo filogenético sugeriu que a tradicional família Fabaceae fosse reclassificada em seis subfamílias, nas quais apenas Papilionoideae e Caesalpinioideae apresentam espécies com habilidade nodulífera Até o presente momento, o gênero Bradyrhizobium tem sido relatado como o principal microssimbionte isolado de Caesalpinioideae, no entanto, a diversidade de rizóbios isolados dessa subfamília ainda é pouco conhecida Com base em uma abordagem polifásica e visando a descrição de uma nova espécie bacteriana, o presente estudo teve como objetivo analisar a diversidade de rizóbios isolados de nódulos de Chamaecrista fasciculata, uma leguminosa caesalpinioideae nativa da região leste, centro-oeste e sul dos Estados Unidos Na filogenia do gene ribossomal 16S RNAr, as três estirpes CNPSo 3394, CNPSo 3442 e CNPSo 3448, foram agrupadas no superclado B japonicum e compartilharam 1 % de identidade nucleotídica (NI) entre si e com B diazoefficiens, B betae, B shewense e B ottawaense Tais resultados confirmam a alta conservação desse gene para análises filogenéticas em Bradyrhizobium A filogenia do espaço intergênico transcrito (ITS) agrupou as estirpes CNPSo em um clado individual com alto suporte estatístico, sendo B japonicum a espécie mais relacionada Para melhores elucidações filogenéticas no grupo em estudo, foi realizada uma análise concatenada com sequências de seis genes housekeeping, atpD, dnaK, glnII, gyrB, rpoB e recA, por meio da técnica de MLSA (multilocus sequence analysis), a qual indicou B diazoefficiens como a espécie mais próxima, com 83 % de similaridade O mesmo padrão filogenético foi verificado na filogenia dos genes housekeeping individuais As filogenias dos genes de nodulação nodC e fixação do N2 nifH agruparam as estirpes com B arachidis, B forestalis e B cajanus A estirpe CNPSo 3448 foi selecionada para análises genômicas de ANI (average nucleotide identity) e dDDH (digital DNA-DNA hybridization) com as espécies de Bradyrhizobium mais relacionadas Os valores resultantes foram inferiores a 933 % no ANI e 535 % na dDDH, confirmando que as estirpes CNPSo pertencem a uma nova espécie de Bradyrhizobium Os perfis de BOX-PCR indicaram variabilidade genética elevada entre as estirpes CNPSo Também foi constatada variabilidade fenotípica, principalmente quanto à utilização de fontes C e a tolerância a antibióticos Considerados em conjunto, esses dados suportam a descrição de uma nova espécie de Bradyrhizobium, para qual o nome Bradyrhizobium niftali foi proposto, com a estirpe CNPSo 3448T (=USDA 151T =U687T =CL 4T) selecionada como estirpe tipo
Descrição
Palavras-chave
Microbiologia, Leguminosa, Cesalpinacea, Legumes, Caesalpiniaceae, Microbiology