Sequenciamento genômico de Bacillus velezensis cepa LABIM22 : um estudo in silico do potencial biotecnológico

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dc.contributor.advisorOliveira Junior, Admilton Gonçalves de [Orientador]pt_BR
dc.contributor.authorTeixeira, Gustavo Manoelpt_BR
dc.contributor.bancaGonçalves, Leandro Simões Azeredopt_BR
dc.contributor.bancaAhmed, Youssef Khamis Youssefpt_BR
dc.contributor.coadvisorPereira, Ulisses de Pádua [Coorientador]pt_BR
dc.coverage.spatialLondrinapt_BR
dc.date.accessioned2024-05-01T12:12:09Z
dc.date.available2024-05-01T12:12:09Z
dc.date.created2020.00pt_BR
dc.date.defesa23.03.2020pt_BR
dc.description.abstractResumo: A exploração de novas estratégias para o controle de doenças no campo que causam perdas consideráveis nas produções cresceu nas últimas décadas Diferentes alternativas vem ganhando destaque com o avanço tecnológico exponencial do final do século XX e que continua até os dias de hoje, dentre elas o uso de microrganismos como agentes de biocontrole vem ganhando destaque por se tratar de uma alternativa natural que utiliza o processos biológicos já existentes no ecossistema para combater doenças, além de contribuir para o manejo integrado de doenças (MID) que leva a uma diminuição do uso de agrotóxicos que causam danos ao meio ambiente quando usados como única estratégia de controle As bactérias do gênero Bacillus chamam a atenção devido a características importantes como a formação de endósporos e uma diversa maquinaria molecular que produz uma vasta gama de metabólitos secundários com diferentes atividades como diminuição do crescimento micelial de fungos fitopatogênicos, promoção de crescimento, indução de sistemas de defesas contra doenças, atividade nematicida dentre outros ainda não descritos Neste trabalho o genoma de um Bacillus velezensis cepa LABIM22 foi estudado para buscar entender melhor os mecanismos genéticos relacionados as atividades antifúngicas apresentadas pela cepa em estudos in vitro Para isto seu genoma foi sequenciado, comparado e analisado buscando genes relacionados a esta atividade bem como sua capacidade de formação de biofilme, característica importante para colonização da rizosfera e estabelecimento do microrganismo Seu genoma possui 3996396 pb e 442 CDS (sequencias codificantes) e um teor GC de 46,4% Utilizando a plataforma antiSMASH foram encontradas 13 BGCs (Biosynthetic Gene Clusters), alguns ligados a síntese de importantes famílias de moléculas antifúngicas como Fengicinas e Surfactinas Diversos genes importantes ligados a regulação/formação de biofilme foram encontrados no genoma como o operon epsA-O ligado a síntese de exopolissacarídeos, abrB um repressor de genes de indução de esporulação e degQ, um gene ligado e degradação de compostos extracelulares Sua diversa maquinaria metabólica, alta similaridade com cepas referência de biocontrole e presença de genes importantes para esta atividade, fazem de LABIM22 um excelente candidato a agente de biocontrole e dá subsídio para mais estudos deste isoladopt_BR
dc.description.abstractother1Abstract: The exploration of new strategies to disease control on crops that cause considerable losses on net production have grown in the past decades Different alternatives have been highlighted with the exponential technological advance that took place by the end of the XXth century and that continues until nowadays, among them the use of microorganisms as biocontrol agents have gained attention since it is a natural alternative that utilizes biological processes already existing in ecosystems to fight diseases, in addition to contribute to the Integrated Disease Management, which brings a decrease on the use pesticides that harms the environment when used as the only control strategy Bacteria belonging to the Bacillus genus have drawn attention due to important characteristics as the endospore formation and a diverse molecular machinery able to produce a vast range of secondary metabolites with different activities such as decrease in mycelial growth of phytopathogens fungi, growth promoting, induction of defense systems against diseases, nematicide activity among others yet to be described In this work the Bacillus velezensis strain LABIM22’s genome was studied in the aim of better understand the genetic mechanisms related to the antifungal activity shown by the strain on in vitro assays To accomplish this its genome was sequenced, compared and analyzed looking for genes related to this activity as well as its capacity of biofilm formation, important characteristic for root and rhizosphere colonization and microorganism establishment Its genome possesses 3996396 pb and 442 CDS (Coding Sequences) with a GC content of 46,4% Using the antiSMASH platform 13 BGCs (Biosynthetic Gene Cluster) were found within the genome, some associated with the synthesis of important families of antifungal molecules like fengycin and surfactins Several important genes related to biofilm regulation/formation were found within the genome like the epsA-O operon linked to the synthesis of exopolysaccharides, abrB a gene repressor of the sporulation induction and degQ which is related to the degradation of extracellular compounds Its diverse metabolic machinery, high similarity to reference biocontrol strains and presence of important genes to this activity make LABIM22 an excellent candidate as biocontrol agent and allows further studies of this isolatedpt_BR
dc.description.notesDissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Microbiologiapt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.uel.br/handle/123456789/9815
dc.languagepor
dc.relation.coursedegreeMestradopt_BR
dc.relation.coursenameMicrobiologiapt_BR
dc.relation.departamentCentro de Ciências Biológicaspt_BR
dc.relation.ppgnamePrograma de Pós-Graduação em Microbiologiapt_BR
dc.subjectMicrobiologiapt_BR
dc.subjectbactériapt_BR
dc.subjectAntígenos de fungospt_BR
dc.subjectBacillus velezensis cepa LABIM22pt_BR
dc.subjectGenomaspt_BR
dc.subjectMicrobiology - bacteriapt_BR
dc.subjectFungal antigenspt_BR
dc.subjectBacillus velezensis strain LABIM22pt_BR
dc.subjectGenomespt_BR
dc.titleSequenciamento genômico de Bacillus velezensis cepa LABIM22 : um estudo in silico do potencial biotecnológicopt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR

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