Acesso à diversidade bacteriana endofítica total e metabolicamente ativa em plantas de milho

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dataload.collectionmapped02 - Mestrado - Microbiologiapt_BR
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dc.contributor.advisorOliveira, André Luiz Martinez de [Orientador]pt_BR
dc.contributor.authorMatsumura, Emilyn Emypt_BR
dc.contributor.bancaNogueira, Marco Antoniopt_BR
dc.contributor.bancaCruz, Leonardo Magalhãespt_BR
dc.coverage.spatialLondrinapt_BR
dc.date.accessioned2024-05-01T14:22:14Z
dc.date.available2024-05-01T14:22:14Z
dc.date.created2012.00pt_BR
dc.date.defesa27.04.2012pt_BR
dc.description.abstractResumo: Bactérias endofíticas podem promover o crescimento vegetal a partir de vários processos, tais como: produção de fitormônios, fixação do nitrogênio atmosférico e disponibilização de nutrientes para a planta Diante da atual necessidade de se buscar uma agricultura ecológica e sustentável, é de grande interesse estudar a diversidade dessas bactérias associadas a plantas de importância econômica e alimentar, como o milho, para que seu potencial seja melhor explorado na agricultura O objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade de grupos dominantes da comunidade bacteriana endofítica associada ao milho, cultivado sob a utilização de fertilizante nitrogenado e inoculação com Azospirillum brasilense O milho foi cultivado sob 8 tratamentos diferentes, combinando-se a aplicação e a não aplicação do fertilizante nitrogenado, com o tipo de inoculação (turfosa na semente e líquida na pós-emergência) Após 3 dias de cultivo, foram coletadas 3 plantas aleatoriamente de cada tratamento, totalizando 18 amotras O colmo de todas as amostras foi armazenado a – 2 °C até o seu processamento A diversidade bacteriana foi avaliada através da análise de bibliotecas de DNA e DNAc, construídas a partir da extração direta de DNA e RNA do colmo do milho, amplificação dos fragmentos do gene 16S RNAr, clonagem e sequenciamento dos fragmentos e comparação das sequências com as informações contidas no bancos de dados 16S RNAr do RDP II Para a biblioteca de DNA, houve predominância dos filos Cyanobacteria e Proteobacteria, com 63 e 37% das sequências, respectivamente, sendo que as cianobactérias foram predominantes nos tratamentos sem inoculação e com inoculação em turfa na semente, e as proteobactérias foram predominantes nos tratamentos com inoculação líquida na pós-emergência da planta, independente se houve ou não aplicação do N Para a biblioteca de DNAc, verificou-se a predominância do filo Proteobacteria, com 92% das sequências, não apresentando diferenças contrastantes entre os tratamentos Pas as duas bibliotecas, os gêneros mais frequentes para o filo Proteobacteria foram Novosphingobium e Sphingomonas Desta forma, esses representantes, além de serem predominantes no milho, podem ser considerados metabolicamente ativos na cultura e, juntamente com as cianobactérias, podem apresentar um potencial para a promoção do crescimento da planta de milhopt_BR
dc.description.abstractother1Abstract: The endophytic bacteria community are known to comprise species able to promote the plant growth through different processes such as plant hormone production, biological nitrogen fixation and nutrient supply The necessity to develop ecological and sustainable agriculture is of ultimate importance to assure the food safety for the future generations In this sense, the study of the bacterial diversity in association with economically importat plants as the maize, is of great interest to better explore its potential in agriculture The aim of this work was to compare and estimate the diversity of the endophytic bacteria community in association with maize grown with (16 kg N ha-1) and without ( kg N ha-1) N-fertilizer input, and different Azospirillum inoculation strategies (peat-based formulation applied over the seeds, and a liquid-based formulation applied at topdressing) After 3 days of cultivation, three plants were collected randomly from each treatment, totaling 18 samples The stems of all samples was stored at -2 ºC until processing Bacterial diversity was assessed through sequence analysis of DNA and cDNA libraries Clonal libraries were constructed with 16S rRNA gene fragments amplified from total DNA and RNA extracts obtained from the maize stems, sequenced and compared with sequences available on the web-based databanks to phylogenetic positioning The comparison of the obtained sequences using the Ribosomal Database Project (RDP) classifier allowed to identify the predominance of the phylum Cyanobacteria and Proteobacteria on the analyzed libraries, which comprised up to 63 % and 37 % of the sequences, respectively The cyanobacteria predominate on the libraries constructed with nucleic acid extracts originated from the treatments without inoculation and from the treatments inoculateds with the peat-based formulation Proteobacteria was the predominant phylum on the libraries constructed with nucleic acid extracts originated from the plants inoculated with the liquid-based formulation, regardles whether or not the N-fertilizer was applied For the cDNA library, a predominance of the phylum Proteobacteria, with 92% of the sequences was found, with no significant differences between the treatments Considering both libraries, the most commonly found genera of the phylum Proteobacteria were Novosphingobium and Sphingomonas Thus, is suggested that these bacteria genera represents the predominant endophytic bacteria in maize, been considered metabolically active inside the plant, and together with the cyanobacteria can present potential to promote the growth of corn plantpt_BR
dc.description.notesDissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Microbiologiapt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.uel.br/handle/123456789/13981
dc.languagepor
dc.relation.coursedegreeMestradopt_BR
dc.relation.coursenameMicrobiologiapt_BR
dc.relation.departamentCentro de Ciências Biológicaspt_BR
dc.relation.ppgnamePrograma de Pós-Graduação em Microbiologiapt_BR
dc.subjectGenética microbianapt_BR
dc.subjectBactérias endofíticaspt_BR
dc.subjectMilhopt_BR
dc.subjectInoculaçãopt_BR
dc.subjectCrescimento (Plantas)pt_BR
dc.subjectMicrobial geneticspt_BR
dc.subjectEndophytic bacteriapt_BR
dc.subjectCornpt_BR
dc.subjectGrowth (Plants)pt_BR
dc.subjectDevelopmentpt_BR
dc.titleAcesso à diversidade bacteriana endofítica total e metabolicamente ativa em plantas de milhopt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR

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