Identificação de regiões promotoras de genes expressos em soja sob déficit hídrico

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dc.contributor.advisorNepomuceno, Alexandre Lima [Orientador]pt_BR
dc.contributor.authorMarin, Silvana Regina Rockenbachpt_BR
dc.contributor.bancaMolinari, Hugo Bruno Correapt_BR
dc.contributor.bancaDomingues, Douglas Silvapt_BR
dc.contributor.coadvisorFuganti-Pagliarini, Renata [Coorientadora]pt_BR
dc.coverage.spatialLondrinapt_BR
dc.date.accessioned2024-05-01T14:46:11Z
dc.date.available2024-05-01T14:46:11Z
dc.date.created2014.00pt_BR
dc.date.defesa26.02.2014pt_BR
dc.description.abstractResumo: A regulação da transcrição gênica é complexa, envolvendo vários mecanismos, desde os elementos presentes no core promoter, elementos proximais e distais até as marcas epigenéticas e a regulação baseada em arranjos da cromatina Os avanços nas tecnologias de transcriptomas têm permitido a análise em larga escala de transcritos e o estudo de suas regiões promotoras, e seus componentes de regulação para confirmação de sua funcionalidade como sequências reguladoras Estudos de promotores responsáveis pela regulação gênica em condições específicas fornecem informações importantes sobre a regulação de genes e podem aumentar as opções de promotores para uso em engenharia genética vegetal Neste contexto, o objetivo do presente estudo foi caracterizar as regiões promotoras de genes diferencialmente expressos em plantas de soja sob condições de déficit hídrico A cultivar brasileira de soja BR 16 foi avaliada em duas condições de déficit hídrico: progressivo (oito dias) e de curto período (25 a 15 min) Os transcritos diferencialmente expressos identificados nos tratamentos de déficit hídrico foram comparados e 134 transcritos com mesma regulação foram encontrados em comum A análise de 1kb a jusante da região promotora desses transcritos revelou a presença de 85 cis elementos comumente encontrados em regiões promotoras de plantas, sendo que 35 estavam presentes em 5% dos TDEs (Transcritos Diferencialmente Expressos) Entre esses cis elementos encontram-se TATA Box, CCAAT Box e GC Box e INR necessários para o acoplamento da maquinaria de transcrição e cis elementos especificamente induzidos por fatores abióticos tais como ABRE, DREB, HEAT e SALT Todos os modelos de promotores apresentaram combinações binárias dos cis elementos GTBX e AHBP podendo haver uma relação entre esse modelo e a regulação transcricional em condição de déficit hídricopt_BR
dc.description.abstractother1Abstract: Transcription regulation is complex, envolving several mechanisms, like elements in the core promoter, distal and proximal elements, to epigenetic traits and also the regulation based on chromatin rearrangements Advances in transcriptome technology have allowed the analysis in large-scale of transcripts, the study of their promoter regions and their regulation components to confirm its functionality as regulatory sequences Studies of promoters responsible for gene regulation under specific conditions provide important information on the regulation of genes and may increase the options of promoters to be used in plant genetic engineering In this context, the objective of the present study was to characterize the promoter region of transcripts differentially expressed (TDEs) in soybean plants under water deficit conditions Brazilian soybean cultivar BR 16 was evaluated under two water deficits: progressive (8 days) and short period (25 to 15 min) The transcripts differentially expressed identified in the treatments were compared and 134 transcripts with the same regulation were identified in common The analysis of 1kb upstream of the promoter region in these transcripts revealed the presence of 85 cis elements generally found in the promoter region of plants, 35 were present in at least 5% of TDEs Among these cis elements were TATA Box, CCAAT Box, GC Box and INR required for transcription machinery coupling, and cis elements specific induced by abiotic factors such as ABRE, DREB, HEAT and SALT All promoter models presented binary combinations with GTBX and AHBP cis elements, which may have a relationship with the transcriptional regulation in water stress conditionspt_BR
dc.description.notesDissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecularpt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.uel.br/handle/123456789/15223
dc.languagepor
dc.relation.coursedegreeMestradopt_BR
dc.relation.coursenameGenética e Biologia Molecularpt_BR
dc.relation.departamentCentro de Ciências Biológicaspt_BR
dc.relation.institutionnameEMBRAPApt_BR
dc.relation.ppgnamePrograma de Pós-graduação em Genética e Biologia Molecularpt_BR
dc.subjectSojapt_BR
dc.subjectGenética molecularpt_BR
dc.subjectSojapt_BR
dc.subjectCondições hídricaspt_BR
dc.subjectRegiões promotoras (Genética)pt_BR
dc.subjectSoybeanpt_BR
dc.subjectSoybeanpt_BR
dc.subjectPromoters (Genetics)pt_BR
dc.subjectPlant genetic engineeringpt_BR
dc.subjectWater requirementspt_BR
dc.subjectMolecular geneticspt_BR
dc.titleIdentificação de regiões promotoras de genes expressos em soja sob déficit hídricopt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR

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