Análise polifásica de estirpes de Bradyrhizobium e descrição de novas espécies

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dc.contributor.advisorHungria, Mariangela [Orientador]pt_BR
dc.contributor.authorDelamuta, Jakeline Renata Marçonpt_BR
dc.contributor.bancaZilli, Jerri Édsonpt_BR
dc.contributor.bancaGomes, Douglas Fabianopt_BR
dc.contributor.bancaRibeiro, Renan Augustopt_BR
dc.contributor.bancaBarcellos, Fernando Gomespt_BR
dc.coverage.spatialLondrinapt_BR
dc.date.accessioned2024-05-01T14:47:59Z
dc.date.available2024-05-01T14:47:59Z
dc.date.created2015.00pt_BR
dc.date.defesa03.03.2015pt_BR
dc.description.abstractResumo: O Brasil sobressai no cenário agrícola por ser um grande produtor de diversas culturas de importância econômica, como por exemplo, a soja (Glycine max) Atualmente, tem-se buscado incrementar a produtividade das culturas, mas o manejo inadequado dos solos e das culturas pode limitar a qualidade dos solos e a sustentabilidade agropecuária A fixação biológica de nitrogênio, realizada por bactérias diazotróficas conhecidas de modo geral como rizóbios, em simbiose com plantas leguminosas, destaca-se como uma importante prática na sustentabilidade agrícola, mas estima-se que a diversidade dessas bactérias ainda é pouco conhecida A técnica polifásica, utilizada hoje na taxonomia e sistemática dos procariotos, engloba informações genotípicas, fenotípicas e filogenéticas para garantir uma classificação apropriada dos microrganismos A essas informações deve-se destacar o incremento, na última década, na incorporação de dados de sequências genômicas e os avanços computacionais para analisar tais sequências, proporcionando uma verdadeira revolução nos estudos taxonômicos e filogenéticos de procariotos Neste trabalho, foram conduzidos estudos polifásicos, incluindo a análise genômica, em grupos de estirpes de Bradyrhizobium com forte indicativo de representarem novas espécies O primeiro estudo englobou duas estirpes, CNPSo 1112 e CNPSo 2833, microssimbiontes de soja perene (Neonotonia wightii) e desmodium (Desmodium heterocarpon), inicialmente relacionadas às espécies Bradyrhizobium elkanii e Bradyrhizobium pachyrhizi, respectivamente A análise polifásica dos dados morfofisiológicos, genotípicos e genômicos suportam a proposta de duas novas espécies, para as quais estão sendo propostos os nomes Bradyrhizobium tropiciagri sp nov (CNPSo 1112) e Bradyrhizobium embrapense sp nov (CNPSo 2833) No segundo estudo, diferenças genéticas (rep-PCR, hibridação DNADNA), genômicas (identidade média de nucleotídeos, conteúdo C+G), fenotípicas (testes morfofisiológicos e perfil de ácidos graxos) e filogenéticas (análise do gene 16S RNAr e multilocus sequence analysis - MLSA) revelaram que um grupo representado por quatro estirpes relevantes para a agricultura e simbiontes de soja, classificadas como Bradyrhizobium japonicum grupo Ia deveriam ser reclassificadas na nova espécie Bradyrhizobium diazoefficiens, sendo a estirpe USDA 11 eleita como estirpe tipo Os resultados obtidos contribuem para o maior conhecimento da diversidade de rizóbios, com ênfase no gênero Bradyrhizobium, que aparentemente representa a maior porcentagem de rizóbios nos trópicos Também houve grande aporte de conhecimento sobre a aplicação da genômica em estudos de sistemática procarióticapt_BR
dc.description.abstractother1Abstract: Brazil stands out in the agricultural scenario as a major producer of several economically important crops, such as soybean (Glycine max) Currently, there is need to increase crop yields, but inadequate soil and crop management can limit soil quality and agricultural sustainability Biological nitrogen fixation, performed by nitrogen-fixing bacteria commonly known as rhizobia in symbiosis with leguminous plants, is highlighted as an important practice in agricultural sustainability, but it is estimated that the diversity of these bacteria is still poorly known The polyphasic technique used today in taxonomy and systematics of prokaryotes includes genotypic, phenotypic and phylogenetic information to ensure proper classification of microorganisms In the past decade, emphasis should also be given to the increasing incorporation of genomic data, as well as to the computational advances to analyze such sequences, providing a revolution in taxonomic and phylogenetic studies of prokaryotes In this study, polyphasic analyses—including genomics—were performed in groups of Bradyrhizobium strains with strong indication of representing new species The first study included two strains, CNPSo 1112 and CNPSo 2833, microsymbionts of perennial soybean (Neonotonia wightii) and desmodium (Desmodium heterocarpon), and originally classified in the species Bradyrhizobium elkanii and Bradyrhizobium pachyrhizi, respectively The polyphasic analysis of morpho-physiological, phenotypic and genomic data supported the proposal of two new species, Bradyrhizobium tropiciagri sp nov (CNPSo 1112) and Bradyrhizobium embrapense sp nov (CNPSo 2833) In the second study, genetic (rep-PCR, DNA-DNA hybridization), genomic (average nucleotide identity - ANI, C+G content), phenotypic (morpho-physiological characteristics and fatty acid profiles) and phylogenetic (analysis of the 16S rRNA gene and multilocus sequencing analysis - MLSA) analyses revealed that a group represented by four strains relevant to agriculture, symbionts of soybean and classified as Bradyrhizobium japonicum group Ia should be reclassified into the new species Bradyrhizobium diazoefficiens, with the USDA 11 strain elected as the type strain The results contribute to a better understanding of the diversity of rhizobia, with an emphasis on the genus Bradyrhizobium, which apparently is the dominant rhizobial species in the tropics In addition, the results contribute to improve our knowledge on the application of genomic information in studies of systematics of prokaryotespt_BR
dc.description.notesTese (Doutorado em Microbiologia) - Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Microbiologiapt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.uel.br/handle/123456789/15371
dc.languagepor
dc.relation.coursedegreeDoutoradopt_BR
dc.relation.coursenameMicrobiologiapt_BR
dc.relation.departamentCentro de Ciências Biológicaspt_BR
dc.relation.ppgnamePrograma de Pós-Graduação em Microbiologiapt_BR
dc.subjectRizóbiopt_BR
dc.subjectFilogeniapt_BR
dc.subjectGenética bacterianapt_BR
dc.subjectMicroorganismos fixadores de nitrogêniopt_BR
dc.subjectMicroorganismos do solopt_BR
dc.subjectRhizobiumpt_BR
dc.subjectMicro-organisms, Nitrogen-fixingpt_BR
dc.subjectMicrobial geneticspt_BR
dc.subjectPhylogenypt_BR
dc.titleAnálise polifásica de estirpes de Bradyrhizobium e descrição de novas espéciespt_BR
dc.typeTesept_BR

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