Diversidade taxonômica de estirpes simbiontes de Chamaecrista fasciculata e descrição de uma nova espécie do gênero Bradyrhizobium

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dataload.collectionmapped02 - Mestrado - Microbiologiapt_BR
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dc.contributor.advisorHungria, Mariangela [Orientador]pt_BR
dc.contributor.authorUrquiaga, Maria Clara de Oliveirapt_BR
dc.contributor.bancaDelamuta, Jakeline Renata Marçonpt_BR
dc.contributor.bancaRibeiro, Renan Augustopt_BR
dc.contributor.coadvisorDelamuta, Jakeline Renata Marçon [Coorientadora]pt_BR
dc.coverage.spatialLondrinapt_BR
dc.date.accessioned2024-05-01T12:14:03Z
dc.date.available2024-05-01T12:14:03Z
dc.date.created2019.00pt_BR
dc.date.defesa12.08.2019pt_BR
dc.description.abstractResumo: Os microrganismos são capazes de interagir positivamente com as plantas em sistemas agrícolas e ecossistemas sustentáveis, proporcionando ganhos nutricionais para ambos os parceiros envolvidos A principal contribuição para a fixação biológica de nitrogênio (FBN), processo chave para a manutenção do balanço de nutrientes na agricultura, ocorre pela associação simbiótica entre leguminosas pertencentes à família Fabaceae e bactérias do solo coletivamente referidas como rizóbios Bactérias do gênero Bradyrhizobium são consideradas como os microssimbiontes predominantes em leguminosas tropicais Nos últimos anos, um número crescente de estudos filogenéticos relata alta diversidade genética dentro desse gênero, que se destaca pela taxa de crescimento lenta (5 a 7 dias) in vitro a 28 oC, ampla distribuição geográfica e gama de hospedeiros, incluindo leguminosas basais da subfamília Caesalpinioideae A ocorrência de nodulação é rara entre os gêneros de Caesalpinioideae, sendo Chamaecrista o maior gênero nodulífero dentro dessa subfamília Neste estudo, foi conduzida uma análise polifásica com 11 estirpes isoladas de nódulos radiculares de Chamaecrista fasciculata, uma herbácea anual multifuncional dos estados do centro-oeste, leste e sul dos EUA Com base na filogenia do gene 16S RNAr, as estirpes foram agrupadas no superclado de B japonicum A análise da seqüência de multilocus (MLSA, multilocus sequencing analysis) com quatro genes housekeeping (glnII, gyrB, recA e rpoB) corroborou a classificação das 11 estirpes como um novo grupo, compartilhando menos de 95,2 % de identidade nucleotídica com outras espécies de Bradyrhizobium A alta diversidade genética entre as estirpes foi confirmada nas análises do espaço intergênico entre os genes 16S RNAr e 23S RNAr (ITS), MLSA e BOX-PCR A média de identidade de nucleotídeos (ANI, average nucleotide identity) e a análise da hibridação DNA-DNA digital (dDDH, DNA-DNA hybridization) apresentaram valores abaixo do limiar de delimitação de espécies quando comparados com as espécies descritas de Bradyrhizobium, com valores de 8974 % e 4 %, respectivamente Além disso, outras propriedades fenotípicas, genotípicas e simbióticas foram avaliadas Cabe destacar a particularidade de crescimento rápido, três dias, de todas as 11 estirpes in vitro a 37 °C, sugerindo um mecanismo eficiente de tolerância a altas temperaturas Os dados obtidos neste estudo suportam a descrição das 11 estirpes como representantes de uma nova espécie, para a qual foi sugerido o nome radyrhizobium frederickii sp novpt_BR
dc.description.abstractother1Abstract: Microorganisms can interact positively with plants in agricultural systems and sustainable ecosystems, providing nutritional gains for both partners involved The major contribution to the biological nitrogen fixation (BNF), a key process for maintenance of the nutrients balance in agriculture, occurs by the symbiotic association between legumes belonging to the Fabaceae family and soil bacteria collectively referred as rhizobia Bradyrhizobium is considered as the dominant symbiotic genus of tropical legumes In the last few years, an increasing number of phylogenetic studies report high genetic diversity within the genus Bradyrhizobium, which stands out due to their slow growth rate (5 to 7 days) in vitro at 28 oC, broad geographic distribution and wide host range, including basal legumes of the subfamily Caesalpinioideae Among the Fabaceae subfamilies, nodulation has long been known to be rare in Caesalpinioideae Chamaecrista is considered the largest genus of nodulating caesalpinioids In this study a polyphasic analysis was performed with 11 strains isolated from root nodules of Chamaecrista fasciculata, an annual multi-functional native legume of USA Based on the 16S rRNA gene phylogeny, the strains were clustered in the B japonicum superclade Multilocus sequence analysis (MLSA) with four housekeeping genes (glnII, gyrB, recA and rpoB) confirmed the new group, sharing less than 952 % nucleotide identity with other species Noteworthy, high genetic diversity among the strains was confirmed in the analyses of the intergenic space between the 16S rRNA and the 23S tRNA (ITS), MLSA and BOX-PCR Average nucleotide identity (ANI) and digital DNA–DNA hybridization (dDDH) values were below the threshold of described Bradyrhizobium species, with values of 8974 % and 4 %, respectively Other phenotypic, genotypic and symbiotic properties were evaluated It is important to highlight the unusual fast growth-three days-by all 11 strains in vitro at 37 °C, suggesting a very efficient mechanism of growth tolerance at high temperatures The data obtained in this study support the description of the 11 strains as representatives of a new species, for which the nomenclature of Bradyrhizobium frederickii sp nov has been suggestedpt_BR
dc.description.notesDissertação (Mestrado em Microbiologia) - Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Microbiologiapt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.uel.br/handle/123456789/10078
dc.languagepor
dc.relation.coursedegreeMestradopt_BR
dc.relation.coursenameMicrobiologiapt_BR
dc.relation.departamentCentro de Ciências Biológicaspt_BR
dc.relation.ppgnamePrograma de Pós-Graduação em Microbiologiapt_BR
dc.subjectRizóbiopt_BR
dc.subjectMicroorganismos fixadores de nitrogêniopt_BR
dc.subjectCesalpinaceapt_BR
dc.subjectNitrogêniopt_BR
dc.subjectFixaçãopt_BR
dc.subjectRhizobiumpt_BR
dc.subjectNitrogen-fixing microorganismspt_BR
dc.subjectCaesalpiniaceaept_BR
dc.subjectNitrogen - Fixationpt_BR
dc.titleDiversidade taxonômica de estirpes simbiontes de Chamaecrista fasciculata e descrição de uma nova espécie do gênero Bradyrhizobiumpt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR

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