Análise transcricional de genes e validação de marcadores moleculares relacionados à resistência à ferrugem (Hemileia vastatrix) do cafeeiro

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dataload.collectionmapped02 - Mestrado - Genética e Biologia Molecularpt_BR
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dc.contributor.advisorPereira, Luiz Filipe Protasio [Orientador]pt_BR
dc.contributor.authorAriyoshi, Carolinept_BR
dc.contributor.bancaTomaz, Juarez Pirespt_BR
dc.contributor.bancaRibas, Alessandra Ferreirapt_BR
dc.coverage.spatialLondrinapt_BR
dc.date.accessioned2024-05-01T14:45:22Z
dc.date.available2024-05-01T14:45:22Z
dc.date.created2014.00pt_BR
dc.date.defesa27.03.2014pt_BR
dc.description.abstractResumo: O Brasil é o principal produtor e exportador mundial de café e possui o segundo maior mercado consumidor Entre os principais objetivos do melhoramento genético de cafeeiros estão os estudos visando resistência de cultivares à ferrugem, doença causada pelo fungo Hemileia vastratix Híbrido de Timor (HDT), uma planta derivada do cruzamento interespecífico natural entre Coffea arabica e Coffea canephora, apresenta resistência à maioria das raças fisiológicas de H vastratix Sendo as progênies de HDT estimadas nos programas de melhoramento Com o objetivo de aumentar e auxiliar o conhecimento sobre os mecanismos de resistência a essa doença, foi feita a caracterização de genes relacionados ao lócus de resistência e também a validação de marcadores moleculares SCARs relacionados à resistência à ferrugem, provenientes de HDT Primeiramente foi verificada a amplificação de genes relacionados à resistência à ferrugem em clones BACs de HDT– CIFC 832/2 Pela técnica de PCR dois genes, NBS-LRR (sinalização) e PR5 (resposta de defesa) foram amplificados no lócus de resistência A análise in silico de um dos BAC também detectou a presença do gene NBS-LRR Através de qPCR a expressão diferencial de NBS-LRR e PR5 foi avaliada nas cultivares resistente IAPAR 59 (com introgressão de HDT) e suscetível Catuaí Vermelho, ambas inoculadas com H vastatrix raça II NBS-LRR e PR5 apresentaram picos de expressão significativamente maiores na cultivar IAPAR 59 72 h após a inoculação Na validação dos marcadores SCARs foram utilizados dois pares de primers que flanqueiam um gene de resistência em uma distância de recombinação menor que 1,6 cM, previamente descritos na literatura Foram avaliados genótipos derivados de IAPAR 59, IPR 99, IPR 97, IPR 98, IPR 14, IPR 17 e de uma geração F4 IAPAR 59 X (Etiópia x Catuaí), provenientes do programa de melhoramento do IAPAR Entre 23 genótipos derivados das cultivares IAPAR 59, IPR 99, IPR 17, IPR 97, IPR 98, IPR 14, somente 1 apresentaram amplificação, e 21 entre 22 amostras de F4 IAPAR 59 X (Etiópia x Catuaí) Os resultados demonstram a possibilidade do uso de Marcadores Moleculares em Seleção Assistida e reforçam a importância dos genes NBS-LRR e PR5 para resistência à ferrugem em cafeeirospt_BR
dc.description.abstractother1Abstract: Brazil is the major coffee producer and exporter in the world and has the second largest consumer market Among the main objectives of coffee breeding programs are studies to improve cultivars resistant to rust, disease caused by the fungus Hemileia vastatrix Timor Hybrid (HDT) a natural interspecific cross between Coffea arabica and Coffea canephora shows resistant to most physiological races of H vastratix Then the progenies of HDT are estimated in breeding programs In order to enhance our understanding of the resistance mechanisms to this disease, we tried to identify genes linked to the resistant lócus and also the validation of markers SCARs related to resistance to rust, from HDT Amplification of genes related in resistance to rust in BAC clones HDT-CIFC 832/2, correlated with resistance loci was verified Using PCR techniques, two resistant related genes, NBS-LRR (signaling) and PR5 (defense response), were amplified in BACs physical mapped to the rust resistance loci The NBS-LRR was also detected in silico analysis of sequences of one BAC clone Using qPCR we observed differential expression of genes NBS-LRR and PR5 in resistant cultivar IAPAR 59 (introgressed with HDT) when compared with the susceptible cultivar Catuaí Vermelho, both inoculated with H vastatrix NBS-LRR and PR5 showed significantly higher expression in IAPAR 59 at 72 h after inoculation In the validation of the markers SCARs two pairs of primers flanking a resistance gene at a distance of less than 16 cM of recombination, previously described in the literature, were used Genotypes derived from IAPAR 59, IPR 99, IPR 17, IPR 97, IPR 98, IPR 14 and one generation F4 IAPAR 59 X (Ethiopia x Catuaí) from IAPAR’s coffee breeding program, were evaluated Among 23 genotypes derived from IAPAR 59, IPR 99, IPR 17, IPR 97, IPR 98 and IPR 14 only 1 showed amplification, and 21 of 22 samples from F4 IAPAR 59 X (Ethiopia x Catuaí) The results show the possibility to use Molecular Marker in Assisted Selection into breeding programs, and also support the role of NBS-LRR and PR5 in rust resistancept_BR
dc.description.notesDissertação (Mestrado em Genética e Biologia Molecular) - Universidade Estadual de Londrina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecularpt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.uel.br/handle/123456789/15145
dc.languagepor
dc.relation.coursedegreeMestradopt_BR
dc.relation.coursenameGenética e Biologia Molecularpt_BR
dc.relation.departamentCentro de Ciências Biológicaspt_BR
dc.relation.institutionnameEMBRAPApt_BR
dc.relation.ppgnamePrograma de Pós-Graduação em Genética e Biologia Molecularpt_BR
dc.subjectCafépt_BR
dc.subjectAspectos genéticospt_BR
dc.subjectFungos-da-ferrugempt_BR
dc.subjectResistência a doenças e pragaspt_BR
dc.subjectHemileia vastatrixpt_BR
dc.subjectCoffeept_BR
dc.subjectRust fungipt_BR
dc.subjectDisease and pest resistancept_BR
dc.subjectGenetic aspectspt_BR
dc.titleAnálise transcricional de genes e validação de marcadores moleculares relacionados à resistência à ferrugem (Hemileia vastatrix) do cafeeiropt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR

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