Análise genômica e controle biológico de Xanthomonas vasicola pv. vasculorum agente causal da estria bacteriana do milho
Data
2022-07-27
Autores
Duin, Izabela Moura
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Resumo
Brasil é o terceiro maior produtor mundial de milho. Existem diversos fatores que reduzem a produtividade da cultura, entre eles doenças foliares, como a estria bacteriana do milho. Essa doença causada pela bactéria Xanthomonas vasicola pv. vasculorum (Xvv) é de recente ocorrência em importantes regiões produtoras do cereal e vem trazendo novos desafios à pesquisa e ao setor produtivo. Estudos envolvendo a caracterização genética de isolados brasileiros de Xvv são necessários para comparar com isolados de outros países. Ainda não existem métodos de controle eficientes para a doença, portanto, a busca por métodos biológicos de controle, incentivaram a execução desse estudo. Sendo assim, os objetivos do trabalho foram: i) fazer estudos comparativos do genoma de isolados brasileiros de Xanthomonas vasicola pv. vasculorum, agente causal da estria bacteriana do milho, com genomas de isolados da bactéria de outras origens geográficas e também com outras espécies de Xanthomonas; e ii) avaliar a atividade antibacteriana contra Xvv e o controle da estria bacteriana do milho dos isolados LAFUEL 01, LAFUEL 02 e LAFUEL 03. Foram comparados seis isolados brasileiros de Xvv com 12 genomas de X. vasicola. O conteúdo G+C (%) encontrado nos genomas de Xvv foi de aproximadamente 63,25%. Os isolados brasileiros de Xvv se mostraram intimamente relacionados com isolados de milho da Argentina e da África do Sul, seguidos pelos dos EUA. Diferenças genômicas podem ser observadas nos genes que codificam sistemas de secreção de proteínas e ilhas genômicas. Um sistema de secreção do Tipo IV foi localizado estando presente apenas no genoma do isolado proveniente da Argentina. Todas as linhagens brasileiras de Xvv de milho analisadas não possuíam o efetor XopAF, que está presente em linhagens de Xvv de cana-de-açúcar. Os isolados LAFUEL 01 e LAFUEL 02 foram identificados como pertencentes ao gênero Bacillus e, com o sequenciamento do genoma do isolado LAFUEL 03 foi possível identificá-lo como B. velezensis. Os isolados LAFUEL 01, LAFUEL 02 e LAFUEL 03, e seus metabólitos apresentaram atividade antibacteriana contra Xvv e foram capazes de controlar a estria bacteriana em plantas de milho. Essa é a primeira publicação de sequenciamento genômico de isolados brasileiros de Xvv de milho. Esse é o primeiro relato de controle biológico para Xvv por Bacillus velezensis.
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Palavras-chave
Bacillus velezensis, Bioinformática microbiana, Controle biológico, Genômica bacteriana, Genômica comparativa, Zea mays, Milho - Xanthomonas vasicola pv. vasculorum, Milho - Estria bacteriana, Bacillus velezensis - Controle biológico, Bacillus velezensis - Genômica bacteriana