Navegando por Autor "Marin, Silvana Regina Rockenbach"
Agora exibindo 1 - 3 de 3
Resultados por página
Opções de Ordenação
Item Identificação de regiões promotoras de genes expressos em soja sob déficit hídricoMarin, Silvana Regina Rockenbach; Nepomuceno, Alexandre Lima [Orientador]; Molinari, Hugo Bruno Correa; Domingues, Douglas Silva; Fuganti-Pagliarini, Renata [Coorientadora]Resumo: A regulação da transcrição gênica é complexa, envolvendo vários mecanismos, desde os elementos presentes no core promoter, elementos proximais e distais até as marcas epigenéticas e a regulação baseada em arranjos da cromatina Os avanços nas tecnologias de transcriptomas têm permitido a análise em larga escala de transcritos e o estudo de suas regiões promotoras, e seus componentes de regulação para confirmação de sua funcionalidade como sequências reguladoras Estudos de promotores responsáveis pela regulação gênica em condições específicas fornecem informações importantes sobre a regulação de genes e podem aumentar as opções de promotores para uso em engenharia genética vegetal Neste contexto, o objetivo do presente estudo foi caracterizar as regiões promotoras de genes diferencialmente expressos em plantas de soja sob condições de déficit hídrico A cultivar brasileira de soja BR 16 foi avaliada em duas condições de déficit hídrico: progressivo (oito dias) e de curto período (25 a 15 min) Os transcritos diferencialmente expressos identificados nos tratamentos de déficit hídrico foram comparados e 134 transcritos com mesma regulação foram encontrados em comum A análise de 1kb a jusante da região promotora desses transcritos revelou a presença de 85 cis elementos comumente encontrados em regiões promotoras de plantas, sendo que 35 estavam presentes em 5% dos TDEs (Transcritos Diferencialmente Expressos) Entre esses cis elementos encontram-se TATA Box, CCAAT Box e GC Box e INR necessários para o acoplamento da maquinaria de transcrição e cis elementos especificamente induzidos por fatores abióticos tais como ABRE, DREB, HEAT e SALT Todos os modelos de promotores apresentaram combinações binárias dos cis elementos GTBX e AHBP podendo haver uma relação entre esse modelo e a regulação transcricional em condição de déficit hídricoItem Prospecção in silico e avaliação da expressão de genes associados ao teor de proteína em grãos de sojaJoaquim, Pamela Isaely de Lima; Henning, Liliane Marcia Mertz [Orientador]; Molinari, Mayla Daiane Corrêa; Marin, Silvana Regina Rockenbach; Girotto, Larissa; Molinari, Mayla Daiane Corrêa [Coorientadora]Resumo: A soja é a principal fonte de proteína vegetal para produção de ração animal Mas para ser utilizada para tal finalidade, o teor de proteína mínimo do grão deve atingir no mínimo 35% Do ponto de vista genético, o que se observa é que ao longo dos anos há uma redução no teor de proteína do grão de soja Assim, em algumas situações, esse teor mínimo não é alcançado Entender os mecanismos genéticos envolvidos no controle dessa característica pode ser útil para o desenho de estratégias biotecnológicas que visem o aumento do teor de proteína no grão de soja Dessa forma, este trabalho visa identificar genes que possam estar associados ao teor de proteína dos grãos de soja O enfoque do trabalho foi voltado a identificar os transportadores de compostos nitrogenados que atuem especialmente em sementes inteiras, tegumento e legume Os resultados do transcriptoma foram validados por meio de PCR em tempo real, nas cultivares BRS 232 e BRS 284, com alto e baixo teor de proteina, respectivamente Foram encontrados 76 genes transportadores de compostos nitrogenados em três bibliotecas de RNA-Seq A partir das análises in silico dos transcriptomas, foram selecionads sete genes, validados por RT-qPCR nas fases de 25-1mg, 1-2mg e 4-5mg Em relação a cultivar de calibração BRS 284, é possível observar que apenas os genes AAP7, AVT3, CAT9 e UMAMIT25 apresentam-se up-regulados, em todas fases de desenvolvimento da semente, na cultivar de maior teor proteico (BRS 232) Em legume, os únicos genes que se apresentaram superexpresso em duas fases, foram o gene CAT9 e o gene UMAMIT25 O gene CAT9 apresentou up-regulação nas fases de 25-1mg e 1-2mg O gene UMAMIT25 apresentou up-regulação em legume de 1-2mg e 25-45mg A superexpressão dos genes UMAMIT25 e CAT9, em futuros estudos, podem acarretar na solução da correlação negativa entre proteína e produtividadeItem "Respostas moleculares de genótipos de soja em condição de hipóxia"Marin, Silvana Regina Rockenbach; Nepomuceno, Alexandre Lima [Orientador]; Lopes, Fabrício Martins; Moraes, Larissa Alexandra Cardoso; Henning, Liliane Marcia Mertz; Corte, Lígia Erpen-Dalla; Pagliarini, Renata Fuganti [Coorientadora]Resumo: A soja figura entre as quatro culturas de maior importância para a agricultura e economia mundial, devido a composição do grão que permite uma ampla aplicabilidade em diversos setores da indústria Mas o sucesso da produção depende de condições ideais de cultivo, que podem ser severamente prejudicadas por uma série de fatores abióticos, entre eles se destaca as condições de alagamento do solo que podem ocorrer em decorrência de modificações climáticas que alteram o regime de chuvas ou por características específicas dos solos hidromórficos A condição de alagamento ou encharcamento do solo provoca a deficiência de oxigênio levando a hipóxia ou anóxia, que promove alterações na composição e estrutura do solo e comprometem a absorção de água e nutrientes pela planta e assim, o desenvolvimento e produção Para se adaptar à esta condição, as plantas desenvolvem respostas complexas que envolvem a regulação da expressão gênica tanto no nível transcricional como pós transcricional Assim, o objetivo deste estudo foi analisar as respostas fisiológicas, agronômicas e moleculares de genes relacionados à condição de hipóxia em genótipos de soja tolerantes e sensíveis à condição de encharcamento, e também analisar o perfil de expressão de miRNAs e seus potenciais genes alvos Foram conduzidos dois experimentos em casa de vegetação um em vaso contendo substrato e simulando a condição de encharcamento para determinar a expressão de genes envolvidos nas respostas a essa condição e outro em sistema hidropônico para identificar os miRNAs expressos em resposta a hipóxia Como resultado, constatamos que a hipóxia gerada pelo encharcamento teve consequências não apenas para o metabolismo do carbono, mas também para o metabolismo do nitrogênio Em síntese os genótipos responderam ao encharcamento inicialmente com estratégias de adaptações anatômicas e morfológicas como a formação de raízes adventícias Os genótipos tolerantes apresentaram um mecanismo envolvendo prioritariamente a mudança de expressão de genes relacionados ao ajuste metabólico regulando a alteração da respiração aeróbica para anaeróbica Em relação ao possível mecanismo de controle pós transcricional mediado por miRNAs em resposta a condição de hipóxia, sugerimos que os miRNAs potencialmente regulam a expressão de genes de fatores de transcrição, genes de sinalização e genes de ajuste do metabolismo primário envolvidos na indução da fermentação, glicólise e degradação do amido, de modo tratamento e genótipo dependentes Nosso estudo forneceu importantes informações sobre as respostas adaptativas de diferentes genótipos de soja à condição de alagamento e também dados inéditos da composição e do perfil de expressão de miRNAs de soja sob hipóxia em cultivares tolerante e sensível ao alagamento