Ogatta, Sueli Fumie YamadaAquino, Marta Xavier Alfredo2026-04-272026-04-272025-02-10https://repositorio.uel.br/handle/123456789/19205Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) é o agente etiológico da Coronavirus disease 19 (COVID-19), doença diagnosticada na China em dezembro de 2019, foi reconhecida como pandemia pela Organização Mundial de Saúde (OMS) em março de 2020 e causou impactos jamais vistos. O presente estudo teve como objetivo identificar o perfil epidemiológico e o padrão de distribuição espacial dos casos confirmados de infecção por SARS-CoV-2 pelo teste de RT- qPCR realizado em um laboratório de referência. As amostras de swabs de nasofaringe e orofaringe, entre outros materiais recebidos pelo CLR IAL PP V para diagnóstico da COVID-19, foram processadas para análise por RT qPCR (Quant Studio 5, Thermo Scientific®). O período de estudo foi de setembro de 2020 a outubro de 2022. Para isso, foram utilizados kits de extração rápida e automatizada de RNA viral e os kits Biomol OneStep/COVID-19 (IBMP) e molecular SARS-CoV-2 (E) (Bio-Manguinhos) para detecção de SARS-CoV-2, além do sequenciamento viral realizado pelo LEIAL. Foram analisadas características como sexo, idade e tempo de liberação dos resultados das amostras recebidas. Os dados foram obtidos no Sistema de Gerenciamento de Ambiente Laboratorial (GAL). No período de estudo foram analisadas 117.331 amostras, das quais 37.439 (31,9%) apresentaram resultado detectável para SARS-CoV-2, 79.860 (68,06%) não detectáveis e 32 (0,02%) tiveram resultado inconclusivo. As amostras com resultado detectável, 55% foram obtidas em pacientes do sexo feminino e 45% em pacientes do sexo masculino. A faixa etária mais acometida foi de 20 a 49 anos. Quanto ao tempo médio em dias de liberação de resultados para COVID-19 foi de 1,28 no CLR IAL PP V no período de estudo, sendo 1,75 em 2020, 1,0 em 2021 e 1,1 em 2022. Das 25 amostras sequenciadas em 2020, as variantes identificadas foram B.1.1.28 em catorze (14) amostras (56,0 %), B.1.1.33 em oito (8) amostras (32,0 %). Foi sequenciada 1 amostra de cada uma das variantes B.1 (4%), B.1.1 (4%) e P.2 (4%) totalizando 12%. Em 2021, foram sequenciados 104 vírus e entre estes vírus, as variantes encontradas mais frequentemente foram P.1 em 52 amostras (50,0%) e P.2 em 15 amostras (14,4%). Em menor quantidade foram encontradas as variantes AY.101, identificadas em 6 amostras (5,8%), AY.43.1 identificadas em 6 amostras (5,8%), B.1.1.28 em 4 amostras (3,8%), B.1.1.7 em 4 amostras (3,8%) e BA.1.1 em 3 amostras (2,9%). As variantes AY.99.2, BA.1, BA.1.14, BA.1.15 e P.1.14 foram identificadas em duas (2) amostras cada (1,9%), totalizando 9,5%. Outras variantes foram encontradas em número mais limitado, isto é, em apenas uma (1) amostra cada (1%): AY.43.2, AY.75.2, AY.99.1 e P.1.8, e totalizaram 4% de amostras sequenciadas em 2021. A distribuição espacial da COVID-19 na região ocorreu de forma heterogênea. A ação do CLR IAL PP V como laboratório de saúde pública foi imprescindível como resposta ao tipo de emergência enfrentada com a pandemia de COVID-19.porCOVID-19SARS-CoV-2 (vírus)PositividadeSaúde públicaEpidemiologiaDissertaçãoCiências Biológicas - MicrobiologiaCiências Biológicas - MicrobiologiaCOVID-19SARS-COV-2PositivityPublic healthEpidemiology